Terminalen vil fremstå som en krysning mellom et fartøy på vei og den arkitekturen som tidligere preget havnene, med store kraner og lagerhaller. Samtidig har terminalen en ambisiøst bærekraftig profil, noe som kjennetegner hele bydelen. Hovedtanken har vært å skape en flytende overgang mellom det sentrale Stockholm og havnerommet rundt terminalen, slik at det blir mengder av byliv på havneområdet. Derfor er byrom og terminal planlagt på samme plan for å gjøre det enkelt å bevege seg til og fra, både for gående og kjørende av alle slag. Samtidig blir taket på terminalbygningen utformet som et variert, grønt landskap. Trapper, ramper, nisjer og sittekroker vil innby til promenade og opphold med utsikt over fergene, skjærgården og Stockholm by.
Solenergi og fjellvarme/-kjøling leveres via integrerte system i bygningen som gjør at terminalen kan være selvforsynt. Värtaterminalen blir miljøsertifisert med niveau Guld.