Byggeriet ligger på et højdedrag ud til universitetssøen og består af tre blokke i varierende højde. Den højeste længe huser hovedindgangen, hvis forplads indrammes af de to lavere bygninger på hver side.
Museet arbejder både med udstillinger, undervisning og forskning. I 2000 stod C.F. Møller for en større ombygning, der bl.a. omfattede ny foyer og en større udstillingssal i stueetagen til særudstillinger.