Generalplanen beskrev den langsigtede plan for sygehusets etapevise udbygning. I begyndelsen af 1990’erne blev to store udvidelser gennemført: vest-udvidelsen med tilbygning af 10.000 m² behandlings- og sengeafsnit, og øst-udvidelsen med renovering af ca. 10.000 m² behandlingsafsnit og 5.000 m² nybyggeri med operationsafdeling, laboratorium, sterilcentral mv.

Op gennem 90’erne blev der gennemført facaderenoveringer, omlægning og ombygning af kostforsyningen og en gennemgribende renovering af sengebygningerne - i alt ca. 17.000 m². C.F. Møller har i perioden 1999-2002 forestået planlægning og projektering af ny onkologisk afdeling og stråleterapicenter, nyt center på 300 m² med to CT-scannere, ombygning af MR-scanner-afdeling på 200 m², planlægning og projektering af ny kontoretage på 1.000 m² samt ny acceleratorbygning på 750 m².

Senest har firmaet arbejdet med at renovere og nyindrette sygehusets åbne psykiatriske afdeling med skærmede afsnit. Første gang var i 2004-2006 med ca. 1.600 m², anden gang i 2010-2011 med ca. 1.100 m². I alle faser har sygehusets brugere været involveret aktivt i processen sammen med arkitekter, ingeniører og sygehusplanlæggere.