Skolen er planlagt omkring to store, indre rumligheder med henholdsvis fællesområder med kantine, festsal og videnscenter gennem tre etager og en større idræts- og multihal med tre baner. Et stort skrånende kobbertag samler de to rumligheder, og murværket opføres i gul tegl. Skolens fysiske placering og udformning tager udgangspunkt i grundens kontakt med Slesvig by og Slien Fjord samt et ønske om en tidløs arkitektur.
A.P. Møller Skolen er en dansk fællesskole med gymnasial overbygning til brug for Dansk Skoleforening for Sydslesvig.
