Sjukhuset är utformat som en låg, urban bebyggelse, med ett genomgående huvudstråk som länkar samman behandlingsbyggnader och patientavdelningar i en enkel och överskådlig struktur.
Arkitektbyrån har under årens lopp haft hand om en rad utvidgningar och ombyggnationer m.m. I 2012 började C.F. Møller på uttbyggnaden av sjukhuset - Det Nya Universitetssjukhuset i Aarhus, vilket ska byggas ihop med Skejby og skapa et samlat sjukhuskompleks ungefär lika stort som en dansk småstad.
