Den är planlagd omkring två stora, inre rumsligheter med gemensamhetsområden som matsal, festsal, vetenskapscenter i tre våningar och en större idrotts och multihall med tre banor. Ett stort sluttande koppartak samlar de två rumsligheterna och murverket är uppfört i gult tegel. Skolans fysiska placering och utformning tar utgångspunkt i platsens närhet till Slesvig stad och Slien Fjord samt en önskan om en tidlös arkitektur.

A.P. Møller Skolan är en dansk grundskola integrerad med gymnasium avsedd för dansk Skoleförening i Sydslesvig.